已知蛋白质N端序列,要想扩增其全基因,怎样设计引物?

yjwsun 1年前 已收到3个回答 举报

risemba 春芽

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首先请上NCBI BLAST搜索之(blastp).或许可以直接查到你研究物种的基因序列.即使没有,有近缘物种的基因序列也是个好的参考,通过比对,选择序列保守区设计引物.
若搜索不到任何信息,就需要通过设计兼并引物.比如你的蛋白质N端序列为
MTAGSR...
上游引物即为5'-ATG NNN NNN ...-3'(参考那个密码子表,和兼并碱基的标法,吾手头没有,记不住额)
下游引物就得反过来,假设蛋白序列为 N-XX-C 其编码DNA为 5'-GAN GAN-3'
则下引物为 5'-NTC NTC-3'

1年前

10

羊儿妹妹 幼苗

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若搜索不到任何信息,就需要通过设计兼并引物。比如你的蛋白质N端序列为 常规PCR反应用于已知DNA序列的扩增,反应循环数为25 35,变性温度为94℃,复

1年前

2

qaaaaaaq 幼苗

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不好意思!不是非常了解,不作答。

1年前

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