如何让设计引物有一段基因序列,想做表达,设计引物是直接根据这段基因序列设计吗?还是查找出这段基因的ORF,根据这段ORF

如何让设计引物
有一段基因序列,想做表达,设计引物是直接根据这段基因序列设计吗?还是查找出这段基因的ORF,根据这段ORF的基因序列设计引物啊
黑毒蓝冰 1年前 已收到1个回答 举报
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84微笑的鱼 幼苗

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直接设计 只要包含了整个CDS区就可以

1年前 追问

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黑毒蓝冰 举报

哦，那CDS和ORF是一样的吗，怎么查找基因的CDS区啊

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恩 差不多回事 ORF是DNA上的 CDS是mRNA上的 看你模板用的是基因组DNA还是cDNA了 反正就是包含了起始密码子到终止密码子的那部分 两边可以适当的延长 这样引物的选择会更多一些

黑毒蓝冰 举报

对了，还有，设计的引物序列可不可以在ORF序列中吗

举报 84微笑的鱼

那不是只能卡在头和尾了 不然P出来的东西就少了引物之外的ORF序列啦

黑毒蓝冰 举报

哦，知道了，还有如果一个基因序列与查找的它的ORF相差二三百个碱基的话，设计引物是用原序列好，还是ORF序列好啊

举报 84微笑的鱼

唉 怎么不明白呢 你得包含整个ORF 所以必须拿整个基因序列 不然引物只能卡在ORF的首尾
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你能帮帮他们吗

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