RAPD实验中样品PCR产物较少的原因

RAPD实验中样品PCR产物较少的原因
植物组织RAPD实验,某样品PCR产物较少,电泳条带不明显,是什么原因?DNA甲基化、DNA发生链间交联(DNA解链温度提高)?或其他原因?
木木夕依 1年前 已收到1个回答 举报

hevei 幼苗

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实验是同一对RAPD引物,比较不同植物个体;还是同一植物个体,不同RAPD引物?
如果是不同个体的话,模版DNA是否电泳检测过?DNA质量如何?有无降解?质量(纯度)如何?正常提取基因组DNA,是没有甲基化等等的问题的.

1年前 追问

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木木夕依 举报

同样的引物,相同一块胶电泳,同种植物组织不同处理,该DNA纯度260/280为1.95,浓度132ng/ul,PCR产物较少,有一定的引物二聚体?DNA甲基化、DNA发生链间交联(DNA解链温度提高)?或其他原因?

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OD260/280有点儿高,建议用RNA酶处理一下。浓度关系应该不太大,PCR的话较低浓度的模版DNA也能做出来。我觉得最大原因是:模版DNA完整么?电泳有无拖尾?

木木夕依 举报

多谢耐心指教。倒数第五条。

举报 hevei

目测很多条带没分出来,建议用聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,琼脂糖分辨率不高。
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