怎么从贫瘠的土壤中提取微生物宏DNA?

怎么从贫瘠的土壤中提取微生物宏DNA?
土壤pH值低,在3-6之间,有机物含量很低,微生物量少.
采用Mo Bio试剂盒提取DNA,琼脂糖凝胶电泳没有条带,PCR扩增时,有些样品能扩增出来.
提取的DNA量少,无法用于测序.
请问有什么好法子能从微生物量少的土壤中提取出较多的DNA呢?
龙的气度 1年前 已收到2个回答 举报

wzf770202 幼苗

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.DNA 直接测序吗?宏基因组就算能测出来 估计也拼不出来吧.也是要扩增后测序.
难道因dna 浓度低 就扩增不到条带了?在pcr上下下功夫,实在不行就做巢式.
另外试剂盒往往一一般会追求比较高的纯度,这样损失也大些,试试SDs 裂解的手提的方法.效果可能会好的 只不过酸性土壤手提最后的 腐植酸浓度太大 PCR 难度增加.加BSA可缓解.

1年前

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snow0916 幼苗

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提取的DNA量少,无法用于测序, 你是用提取的直接测序么? 如果能用PCR扩增,就用扩增产物去测序啊,当然具体要看你提DNA测序干嘛,如果要看各种微生物的分布比例,PCR扩增就不合适了,它会让多的更多

1年前

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