下列关于基因工程的说法正确的是（　　）

A、限制性核酸内切酶能识别一种特定的核苷酸序列，并能将特定位点之间的磷酸二酯键断开，A错误；
B、载体不是工具酶，B错误；
C、限制酶1（-↓GATC-）和限制酶2（-GGATC↓C-）剪出的黏性末端相同，都是GATC，C正确；
D、由于密码子的简并性，在人工合成目的基因的过程中，根据蛋白质中氨基酸序列合成的目的基因碱基序列与生物体内原有基因的碱基序列不一定相同，D错误．
故选：C．

点评：
本题考点： 基因工程的原理及技术．

考点点评： 本题考查基因工程的原理及技术，要求考生识记基因工程的原理、操作工具及操作步骤；识记密码子的特点，能结合所学的知识准确判断各选项，属于考纲识记和理解层次的考查．