these are kept today in the Andersen Museum ,which is in the

这些东西至今仍旧收藏在安徒生博物馆内,博物馆是安徒生在欧登塞出生的房子.
which后面的定语从句是修饰Andersen Museum的
where=in which,后面的定语从句修饰the house.
等于是定语从句套定语从句.
但是我们记得这样一个故事,那就是人们总是伪装,然而他们并非如此.
the story后面省略了that,后面的从句是补充说明the story的内容
that they are not是something的定语从句.

不懂

他出生的欧登塞的房子里的东西都保存在在安徒生博物馆中。这里的WHICH是用来修饰前边的these的，
第二句直译：我们总能记起这样的故事，人们总是伪装着，即使他们并不是那样
最好翻译成：我们总能听到这样的故事，人们总是将他们不擅长的伪装起来...