通俗解释一下Lander-Waterman theory或Lander-Watermanmodel 该理论是为解决什么问

通俗解释一下Lander-Waterman theory或Lander-Watermanmodel 该理论是为解决什么问题服务的?
不用链接什么的,通俗的说一下原理,它为大量鸟枪法随机测序的片段用计算机进行自动拼接提供了可能.这原理怎么为计算机提供理论支持的.适回答的程度追加分.
二楼请补充一下:基因组组装与基因组覆盖度关系。看好你,呵
nadialihua 1年前 已收到3个回答 举报

kelly_媚 幼苗

共回答了16个问题采纳率:100% 举报

楼上一点都不通俗
举个例子
序列假如是ATCGAAAATCG
你一次shotgun得到ATCG ATCG
又一次shotgun得到CGAA AATC
又一次shotgun得到GAAAAT
单次的shotgun不会覆盖到所有的碱基序列,也没法判断片段的前后顺序.
如果再来一次shotgun,就可能拿到之前没拿到的片段,片段也可能会落在前一次片段之间的衔接部分,反复多次shotgun以后,我们就能把这些零碎的片段拼接成完整的序列.
就像我给你的例子一样,你完全可以通过shotgun的结果来推断完整的序列.
对于基因组这样大量的数据,显然通过你人工拼接是不现实的,于是借助计算机.

1年前

6

yangzi0201 幼苗

共回答了1个问题 举报

这个模型是用来做基因组装的。
鸟枪法做了shotgun后,每个碱基被检测的概率是很小的,碱基长度长,
即 p小,n长,二次分布就近似为泊松分布。
在这个理论下,碱基期望深度,(就是每个碱基被检测的次数)为泊松分布的期望值u,基因组覆盖率为1-exp(-u)。...

1年前

2

酷叶情枫 幼苗

共回答了33个问题 举报

建议你去一些专业的网站查询,或者去一些具体部门咨询。这些问题一般资料都比较难收集。只有专业性的部门和机构才有~~

1年前

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