什么是基因组DNA污染?为什么设计引物时要跨外显子?

什么是基因组DNA污染?为什么设计引物时要跨外显子?
看文献有这么一句话:“引物设计时应该考虑到引物要有不受基因组DNA污染影响的能力,即引物应该跨外显子,最好是引物能跨外显子的接头区”,请解释一下什么是"基因组DNA污染"?会对引物设计和PCR造成什么影响?引物为什么要跨外显子?为什么最好能跨外显子接头区?谢谢~~
幻采圣代 1年前 已收到4个回答 举报

水上行风 幼苗

共回答了17个问题采纳率:82.4% 举报

提RNA的时候有可能混了基因组DNA.
这样的话,PCR的时候,假如这个基因根本没表达,结果因为混了DNA进去,PCR就可以P出结果.但是这个条带不是从RNA来的.这就是DNA污染,它会干扰PCR的结果.
可以在提取RNA后,用DNA酶处理,这样分解可能混入的DNA来避免.也可以通过合理设计引物来避免,即使有DNA混入,这样设计的引物也只扩增RNA,而不扩增DNA.
这就要求引物得最好设计成跨外显子接头.因为DNA上的基因外显子和内含子是隔开的,而RNA上内含子被切掉了,是外显子链接在一起.剩下的,自己想去吧,已经快接近结果了……

1年前

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hvmaa 幼苗

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孩子,一楼的是对的。rna是不包含内含子的。所以你在基因组前一个外显子中设计正向引物,后一个设计反向引物,cDNA就能p出相应条带,而基因组dna由于中间还有一段内含子,要嘛由于条带太大p不出来,就算p出来你也可以识别。其实关键还是做好dna消化。做完之后跑带确认就行了。...

1年前

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7fan 幼苗

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就是你的引物一定要具有特异性,如果你设计的引物可以扩出好几个基因,这就是DNA污染了,跨外显子是为了确保所扩大基因能够编码功能蛋白,是自己所要研究的目的基因!

1年前

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dadazhang 幼苗

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科技名词定义
中文名称:人类基因组计划 英文名称:human genome project;HGP;Human Genome Project 定义1:于20世纪80年代提出的,由国际合作组织包括有美、英、日、中、德、法等国参加进行了人体基因作图,测定人体23对染色体由3×109核苷酸组成的全部DNA序列,于2000年完成了人类基因组“工作框架图”。2001年公布了人类基因组图谱及初步分析结...

1年前

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