基因的克隆,转导,表达,在对目的基因PCR时,为什么一些人设计的上游引物不是从ATG开始的,而是从中上段开始

基因的克隆,转导,表达,在对目的基因PCR时,为什么一些人设计的上游引物不是从ATG开始的,而是从中上段开始
什么时候引物设计必须从目的基因的ATG开始,什么时候是可以从中间设计引物的
林雅馨 1年前 已收到4个回答 举报

zhaoxiantao 幼苗

共回答了19个问题采纳率:100% 举报

克隆基因的编码框时,必须从ATG开始或UTR处开始.当你想表达这个基因时,PCR产物必须包括完整的读码框;当你需要该基因融合GFP时,不仅需要从ATG开始,终止密码子必须突变掉,而且目的基因与GFP必须在一个读码框中.
而需要监测目的基因的表达水平时,如果使用RT-PCR,则最好是从基因的中上段开始设计引物,因为在RNA提取时,可能得到的部分RNA有小部分降解,或反转录时,只反转录了一部分,没有到ATG这端,因此,从中上有设计的引物更容易监测到目的基因的表达.

1年前 追问

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林雅馨 举报

非常感谢您的回答,您的宝贵知识让我解开疑惑,在此表示衷心的感谢! 我们现在做的是一个基因的克隆表达及其所表达的蛋白质对抗鼻咽癌作用的研究,这个基因之前也有人研究过,也是克隆表达,但所研究的作用不同,他们的是抗肿瘤活性研究.他们在PCR那一步,所设计的引物就不是从ATG开始,而是从读码框的中上游设计引物的,因此,对于目的是表达这个基因时,PCR产物又不包括完整的读码框这种情况很是不了解.大侠,能帮小弟想想这情况的原因吗

举报 zhaoxiantao

抗肿瘤活性的研究中,这方面我不是很熟悉,我是从事植物方面的!下面是我个人的看法: 他们是不是不需要完整的蛋白表达?只是需要表达该蛋白的部分肽,而且没有ATG的话,不可能翻译呀!如果他们在文章中没有写错的话,有可能是只需要表达部分蛋白(如:活性小肽),而且在表达载体上或引物上添加有ATG。 还有一点,你看看他们PCR出来的这一段是不是和全长基因(从ATG开始的)是一个读码框的? 我建议你最好给文章的作者发个email,问问他们是怎么回事?

林雅馨 举报

嗯,好的!很感谢你的宝贵意见.昨晚我也试着在那篇论文里找作者的邮箱,但论文里除了作者的工作单位,就没有其他的联系方式了.我问一下我们的老师,看从哪里可以找到作者的联系方式,然后给他发个email. 对于你的帮助,我心里无限感激!

samary 幼苗

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因为如果是融合表达的载体,有起始密码子的,不需要ATG起始,而设计者认为前面一段对目的蛋白的功能不受影响,因此也就可以去除。您好!很感谢您的回答.我很同意一楼的说法"当你想表达这个基因时,PCR产物必须包括完整的读码框",之前我也是这种观念,因此对于做基因的克隆表达时,引物不是从目的基因的ATG开始的即PCR产物没有包括完整的读码框的很是疑惑不解,今天看到你的回答"设计者认为前面一段对目的蛋白的功...

1年前

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rainy8832 幼苗

共回答了2个问题 举报

很多情况下载体是带有ATG和TAA的,自己序列里的信号肽不会影响表达后的功能!

1年前

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宋维鹏 幼苗

共回答了14个问题 举报

目的基因的表达必须从ATG开始,检测目的基因是否有表达的情况下,可以中间设计引物

1年前

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