将酵母菌处理获得细胞质基质和线粒体.用超声波将线粒体破碎，线粒体内膜可自然反卷成小的膜泡，原来内膜的内侧面位于膜泡的外表

A、酵母菌在细胞质基质中可以利用葡萄糖进行无氧呼吸产生二氧化碳，A错误；
B、酵母菌在细胞质基质中可以利用丙酮酸进行无氧呼吸的第二阶段，产生二氧化碳，B错误；
C、虽然是小膜泡是由线粒体内膜反卷而成，可以进行有氧呼吸的第三阶段，但是不能利用葡萄糖进行有氧呼吸产生二氧化碳，C正确；
D、酵母菌可以利用丙酮酸在线粒体基质中进行有氧呼吸的第二阶段，产生二氧化碳，D错误．
故选：C．

点评：
本题考点： 有氧呼吸的过程和意义；无氧呼吸的概念与过程．

考点点评： 对有氧呼吸的具体过程、场所、物质变化和无氧呼吸的过程场所、物质变化的综合理解应用，把握知识点间的内在联系是解题的关键．